Si analizzano i meccanismi grazie ai quali le proteine interagiscono fra di loro e agli acidi nucleici (DNA o RNA) in modo specifico per assolvere attività necessarie al corretto funzionamento della cellula. Una volta prodotte grazie all’informazione contenuta nel DNA, le catene di aminoacidi che formano le proteine si ripiegano in strutture complesse per raggiungere una conformazione finale. Tale “forma” è essenziale per il legame con altre proteine o con il DNA. Si utilizzano approcci computazionali per comprendere la relazione fra forma e funzione delle proteine, con particolare riferimento a conformazioni difettose e patologiche (per esempio quelle che si verificano in caso di ischemia o nelle distrofie).